Ruang gawat darurat merupakan pelayanan yang menyediakan penanganan awal bagi pasien yang menderita sakit dan cedera, yang dapat mengancam kelangsungan hidup. Pelayanan Gawat Darurat di Puskesmas I Mendoyo dibuka 24 jam. Dalam pelayanan Gawat Darurat berbeda dengan penanganan pasien rawat jalan, dimana pasien yang datang dengan kegawatdaruratan ditangani sesuai dengan TRIAGE yang artinya pemilihan pasien menurut derajat kegawatan bukan siapa yang datang terlebih dahulu, setelah ditangani kemudian dilanjutkan dengan melengkapi administrasi.